على الرغم أن الجسم يأخذ حاجته من الفيتامين ويطرح الزائد خارج الجسم عن طريق البول إلا انه من الممكن أن يزيد في الجسم مما قد يؤدي لحدوث آثار جانبية ممكن ان تكون خطيرة مثل الشعور بالوخز و الضعف العام والخدر وإصابة الكبد بالتلف لانه يتم تخزينه بالكبد، و حدوث مشاكل بعملية الهضم مثل الإسهال او الإمساك، واضراب في النوم وفي نبضات القلب وغيرها من الأمراض، ولعلاج زيادة فيتامين ب 12 يمكن للشخص أن يتوقف عن أخد الإبر و التوقف عن تناول المكلات الغذائية التي تحتوي على ب 12، ويمكن اتباع نظام غذائي صحي ليحصل الجسم على العناصر الغذائية بتوازن، كما يمكن التقليل من الاطعمة التي تحتوي فيتامين ب 12 وتناولها بتوازن مثل اللحوم والمأكولات البحرية والبيض، كما يمكن علاج الأمراض الناتجة عن زيادته بالطريقة التي تناسب كل حالة.