هي الأمراض التي تصيب جوف (داخل) الجسم وتشمل القناة الهضمية وجهاز الدوران والجهاز البولي والجهاز التنفسي والجهاز التناسلي، أي تشمل جميع الأمراض التي تبدأ بالفم والأنف وتنتهي بفتحة الشرج (أي أنه يتم استثناء الرأس والأطراف).
تعرف الأمراض الباطنية بالأمراض التي تصيب أجهزة الجسم محل البطن، تبدأ من الفم وتنتهي من فتحة الشرج، ومنها التهابات البلعوم، وأمراض المعدة كقرحة المعدة، والتهابات الأمعاء الدقيقة، والتهاب القولون، بالإضافة إلى الناسور والباسور الشرجي.
هي الإعتلالات التي تصيب أجهزة الجسم مَحَلَ البطن ، بشكل يعيقها أو يمنعها من آداء وظيفتها ، مسببة بذلك أعراضاً تدل عليها , وتختلف باختلاف العضو المصاب وحدّة الإصابة , فغالباً ما تصيب أعضاء الجهاز الهضمي وامتداداته ..