يعد السبب الرئيسيّ للإصابة بسرطان العمود الفقريّ غير معروف، فقد يتسبب التعرض لبعض المواد المسببة للسرطان الإصابة بسرطان العموي الفقريّ كما تزيد فرصة الإصابة بسرطان العمود الفقري لدى الأشخاص الذي لديهم ضعف في جهاز المناعة كما تصاب بعض العائلات بسرطان العمود الفقري أكثر من غيرها، وقد ينتج المرض في بعض الحالات بسبب بعض الاضطرابات الوراثية والتي تتضمن ما يأتي:
الورام الليفي العصبي (بالإنجليزية: Neurofibromatosis).
داء فون هيبل - لينداو (بالإنجليزية: Von Hippel-Lindau disease).