يمكن علاج فطريات الفم بعد التاكد من التشخيص لدى الطبيب بوصف المراهم او الجل الذي يحتوي على مواد مضادة للفطريات ودهنه على الفم من الداخل ولا مانع من ابتلاع بقاياه. ويوجد مستحضرات اخرى على شكل محاليل او معلقات تحتوي على الادوية المضادة للفطريات والتي توضع على الفم واللسان ايضا. في الحالات الشديدة يتم وصف الاقراص المضادة للالتهابات الفطرية مرة واحد في الاسبوع ثم تكرار تناولها بعد اسبوع واحد.
عادة ما يكون علاج الفطريات الفموية بالأدوية التي تعطى على شكل حبوب للبلع أو للمص أو السائلة التي يشطف بها الفم. أما إن لم تنفع الأدوية الموضعية فيتم اللجوء إلى الأدوية الأوسع عملا. ويذكر ان اختيار الدواء المناسب يعتمد على سن المصاب ودرجة مناعته Mayoclinic