التفرقه بينهما قد تقون مشتته احيانا لكن بشكل عام فإن الم الظهر : غالبا ما يكون الم منتشر لا يصاحبه الم في البطن قد يظهر ثم يختفي ثم يظهر مره اخرى الم الكلى غالبا يكون في جانب الجسم او عند الخاصره وهي اسفل الظهر وقد يصاحبه الم في البطن ويدوم ويكون مستمر وغالبا ما يكون في جانب واحد فقط وبشكل عام قد تظهر العديد من الاعراض الاخرى التي قد تبين لنا اذا كانت الحاله ناتجه عن مشاكل في الظهر او الكلى ولكن لابد من المتابعه والكشف المبكر والذهاب للطبيب المختص في حال استمرار الالم او ازدياده .
من الممكن أن تكون القدرة على التفريق بين ألم الظهر و ألم الكلى صعبا أحيانا و هذا يعتمد على مكان ألم الظهر فعندما يكون ألم الظهر في أسفل الظهر فمن الممكن أن يختلط بينه وبين ألم الكلى الذي عادة ما يظهر في جوانب الجسم ومن الممكن أن يمتد إلى أسفل الظهر
أما آلام الظهر التي تظهر في منطقة منتصف الظهر عادة فهي مختلفة عن آلام الكلى حتى أن مشاكل أو آلام الكلى عادة ما تترافق مع أعراض أخرى غير آلام الجوانب الممتدة إلى أسفل الظهر مثل الشعور بحرقة أثناء التبول أو وجود الدم في البول