سمي حصان طروادة بهذا الاسم بسبب التشابه بينه وبين الحصان الخشبي من حيث العمل في أسطورة حصان طروادة الذي اختبأ به عدد من الجنود اليونانيون وكانوا السبب في فتح طروادة
سمى حصان طروادة بهذا الأسم تيمناً بالحصان الخشبي العملاق (حصان طروادة )الذي يحكى أسطورة حرب الأغريق واليونانيين , وهذا الحصان يوجد الآن في أحد المدن التركية ويعتبر أكبر حصان خشبي في العالم وتم إصدار برنامج حصان طروادة لمحاربة الفايروسات في الحواسيب تيمناً بهذا الحصان الأسطورة.