يشتبه في تشخيص حصوات الكلى عند ملاحظة النمط النموذجي للأعراض وعندما يتم استبعاد الأسباب المحتملة الأخرى لآلام البطن أو الجناح. وهو الاختبار المثالي لتشخيص حصوات الكلى أمر مثير للجدل. عادة ما يتم إجراء اختبارات التصوير لتأكيد التشخيص. سيقوم العديد من المرضى الذين يذهبون إلى غرفة الطوارئ بإجراء فحص CT غير متباين. يمكن القيام بذلك بسرعة وسيساعد على استبعاد الأسباب الأخرى للألم أو البطن. ومع ذلك ، فإن التصوير المقطعي بالاشعة المقطعية يعرض المرضى لإشعاع كبير ، ومؤخرًا ، ثبت أن الموجات فوق الصوتية مع الأشعة السينية في البطن فعالة في تشخيص حصى الكلى.
في النساء الحوامل أو أولئك الذين يجب تجنب التعرض للإشعاع ، قد يتم إجراء فحص بالموجات فوق الصوتية للمساعدة في إنشاء التشخيص
يتم تشخيص وجود الحصى في مجرى البول عن طريق : * عمل تحليل للبول بحيث يتم ملاحظة وجود نسبة عالية من الأملاح و الرّواسب في البول عند فحص العيّنة باستخدام الميكروسكوب . * عمل تحليل لوظائف الكلى . * عمل صورة الترا ساوند لتتجويف البطني و الحوض بهدف تحديد مكان وجود الحصى . * ملاحظة الأعراض التي يعاني منها مريض الحصى . و من الجدير بالذّكر أنّ حصى مجرى البول من الممكن ان يتواجد في الحالبين أو الكلى أو المثانة .