تعتبر أمراض الغدة الدرقية عديدة ومتشعبة، وهنالك عدة تقسيمات لها، أبرزها وفق الخلل الذي تسببه في إفرازات الغدة الدرقية، إلا أن بعضها لا يسبب أي اضطراب في مستوى هرمونات الغدة، ويكون هذا التقسيم على النحو الآتي:
أمراض تسبب نشاط الغدة الدرقية: أو فرط هرموناتها، مثل داء غريفز، والأورام الغدية الحميدة، وسرطان الغدة الدرقية، والتهاب الغدة تحت الحاد.
أمراض تسبب كسل الغدة الدرقية: أبرزها مرض هاشيموتو، والتهاب الغدة الناجم عن اختلال المناعة الذاتية، وتناول بعض الأدوية التي من شأنها تعريض المريض لكميات كبيرة من اليود، وتناول دواء الليثيوم، وكسل الغدة الدرقية الخلقي.