ان تقدم العلم يجعل من فروع عام النباتات تزيد وتتفرع اكثر واكثر ، وان اي فرع أساسي ممكن ان يتفرع الى افرع اخرى. وعلى العموم سنذكر الان بعض فروع علم النباتات الرئيسية: ١- فرع التصنيف حيث يصنف النباتات الى عائلات واصول وفروع وأنواع . ٢- فرع التشريح حيث يبين التفاصيل التركيبية لمكونات النباتات. ٣- فرع الشكل الخارجي ويهتم بأشكال النباتات الظاهرة أطوالها واتساعاتها وما عليها من تفرع الأغصان او الأوراق او الزهور والورود. ٤- فرع البئة النباتية والذي يدرس مدى تأثر النباتات بما حولها من مؤثرات . ٥- فرع وظائف النبات الذي يهتم بما يحدث من عمليات حيوية. ٦- فرع امراض النباتات الذي يهتم بما يصيب النباتات من امراض وطرق علاجها والوقاية منها. ٧- فرع وراثة النباتات. ويهتم بمجمل الاختلافات بين عائلات النباتات. ٨- فرع الخلية والذي يهتم بدراسة التركيب والوظيفة للخلايا. ٩- فرع الفطريات والذي يدرس علاقتها بالنباتات (طيفور). ١٠- فرع الطحالب ويدرس خصوصيات الطحالب وتقاربها من النباتات العليا. ١١- فروع لكل من بكتيريا وفيروسات النباتات التي تدرس انواع البكتيريا والفيروسات التي تصيب النباتات ومحاربتها.