الكائنات الحية الدقيقة هي الكائنات الصغيرة في الحجم والتي لا تُرى الا بالمجهر الضوئي او الإلكتروني ، وعلى هذا الأساس توجد اربع مجموعات ضمن هذه الكائنات هي : ١- اصغر الكائنات الدقيقة وهي الفيروسات ، حيث انها تعتبر حلقة الوصل بين الجماد والحيوان ؛ فإذا تواجدت لوحدها لا تستطيع التكاثر لوحدها وهي بحاجة الى عائل يساعدها على ذلك.وهي لا ترى الا بالمجهر الإلكتروني . ٢- البكتيريا وهي اكبر من الفيروسات نستطيع رؤيتها من خلال المجهر الضوئي. بدائية النواة وليس لها غشاء نووي محدد تحتوي على كروموسوم واحد مبعثر داخل السيتوبلازم ، ولها اشكال مختلفة مثل كروية وعصوية وحلزونية. ٣- الفطريات : على الرغم من ان الفطريات قسم منها يُرى بالعين المجردة الا انه يوجد منها صغير جداً لا يرى الا بالمجهر الضوئي . ٤- الطفيليات ، ايضاً الطفيليات منها ما يُرى بالعين المجردة ولكن فيها أعضاء لا يُرى الا بالمجهر الضوئي.