من أشهر الأمراض البكتيرية التي قد تصيب الطيور الإيروموناس Aeromonas مجموعة بكتيريا تسبب الجذام والسل الليمونية Citrobacter بكتيريا سالبة الجرام كلوستريديا Clostridia بكتيريا لا هوائية تسبب الكثير من الأمراض مثل: الكزاز، الغنغرينا الغازية، التسمم الغذائي وغيرها. بكتريا قولونية E. coli بعض سلالات هذه البكتيريا تسبب التسمم الغذائي الشديد الأمعائية Enterobacter بكتيريا سالبة الجرام لا هوائية، ومتحركة بسبب امتلاكها لسوط يساعدها على التنقل. الكلبسيلة Klebsiella بكتيريا تسبب التهاب المسالك البولية المتفطرات Mycobacteria مجموعة بكتيريا تسبب الجذام والسل. الباستوريلة Pasteurella بكتيريا سالبة الجرام لا هوائية قد تسبب الوفاة. بروتيوس Proteus بكتيريا سالبة الجرام تسبب التهابات الزائفة Pseudomonas بكتيريا شائعة وموجودة في جميع أنحاء العالم في التربة والمياه والنباتات. السالمونيلا Salmonella بكتيريا تسبب التسمم الغذائي وتتواجد بشكل رئيسي في الأمعاء السراتية الذابلة Serratia marcescensبكتيريا سالبة الجرام، تسببالتهابات المسالك البولية والجهاز التنفسي، التهاب الشغاف، التهاب العظم، تسمم الدم، التهابات الجرح، التهابات العين، والتهاب السحايا
من أشهر الأمراض البكتيرية التي قد تصيب الطيور: الإصابة بميكروبات السالمونيلا، والمرض التنفسي المزمن، ومرض كوليرا الطيور، ومرض الزكام المعدي في الطيور، والتيفوئيد.