هناك العديد من الأسباب التي تؤدي إلى التهاب المسالك البولية، مثل الإصابة ببكتيريا معينة أو فيروس معين ، علما أن الأنثر هي أكثر عرضة للإصابة بسبب طبيعية الجهاز التناسلي الخاص بها ومن أسباب الإصابة مايلي:
الأمراض المنقولة جنسيا، كالسيلان والكلاميديا.
بعض العادات الخاطئة، مثل عدم التخلص من كمية البول كاملة أثناء التبول، أو العادات الخاطئة في المحافظة على نظافة الجهاز التناسلي، مثل تنظيف المنطقة بالمواد الكيميائية الشديدة.
الإصابة ببعض الأمراض التي تثبط الجهاز المناعي.
الإصابة بالتهابات مختلفة في أعضاء الجسم المختلفة والتي تنتقل إلى المسالك البولية لاحقا، مثل التهابات الجهاز التنفسي.
1-عدم التخلص من كمية البول كاملة.
2-الإصابة ببعض الأمراض المزمنة مثل: مرض السكري.
3-عدم الاهتمام بالنظافة الشخصية ونظافة المناطق التناسلية.
4-حدوث تضيق أو انسداد في المسالك البولية نتيجة عدة أسباب مثل: تضخم حجم البروستات عند الرجال.
5-وجود عيوب خلقية أو حصوات بالكلى والمثانة.