عن طريق التفاعل عموما إما عن طريق التفاعل مع نفسها لتكوين غاز الهيدروجين H2 أو التفاعل مع ذرات أخري لتكوين جزيئات مستقرة مثل التفاعل مع الكلور لتكوين الهيدروكلولريك HCl أو عن طريق التفاعل مع مجموعات ذرية لتكوين مركبات مستقرة مثل حمض الكبريتيك وعلي العموم الهيدروجين من أكثر العناصر دخولا في المركبات خاصة العضوية منها
بوجودها على شكل جزيآت ثنائية في الطبيعة فلا يوجد ذرات هايدروجين منفردة في الطبيعة فذرة الهايدروجين تحتوي على الكترون واحد و المدار الأول في الذرة يتسع لالكترونين ليصل إلى حالة الاستقرار كما يتفاهل الهايدوجين مع عناجصر اخرى بروابط تشاركية مثل الكربون لتكوين السكر و المواد العضوية ومع الأكسجين لتكوين الماء